Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QLW9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QLW9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QLW9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QLW9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QLW9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QLW9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QLW9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QLW9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QLW9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3QLW9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QLW9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QLW9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QLW9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QLW9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QLW9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QLW9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QLW9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QLW9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QLW9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QLW9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QLW9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QLW9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QLW9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QLW9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QLW9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QLW9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QLW9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QLW9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QLW9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QLW9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QLW9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QLW9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QLW9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QLW9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QLW9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QLW9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QLW9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QLW9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QLW9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QLW9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QLW9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QLW9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QLW9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QLW9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3QLW9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QLW9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QLW9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QLW9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QLW9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QLW9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QLW9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QLW9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QLW9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QLW9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QLW9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QLW9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QLW9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QLW9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QLW9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QLW9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QLW9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QLW9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QLW9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QLW9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QLW9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QLW9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QLW9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QLW9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QLW9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QLW9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QLW9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QLW9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QLW9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QLW9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QLW9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QLW9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QLW9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QLW9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QLW9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QLW9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QLW9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QLW9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QLW9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QLW9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QLW9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QLW9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QLW9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms