Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms