Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BMQ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BMQ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BMQ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BMQ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BMQ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BMQ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BMQ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BMQ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BMQ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BMQ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BMQ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BMQ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BMQ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BMQ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BMQ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BMQ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BMQ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BMQ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BMQ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BMQ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BMQ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BMQ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BMQ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BMQ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BMQ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BMQ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BMQ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BMQ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BMQ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BMQ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BMQ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BMQ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BMQ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BMQ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BMQ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BMQ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BMQ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BMQ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BMQ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BMQ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BMQ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BMQ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BMQ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BMQ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BMQ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BMQ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BMQ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BMQ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BMQ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BMQ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BMQ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BMQ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BMQ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BMQ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BMQ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BMQ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BMQ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BMQ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BMQ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BMQ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BMQ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BMQ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BMQ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BMQ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BMQ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BMQ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BMQ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BMQ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BMQ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BMQ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BMQ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BMQ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BMQ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BMQ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BMQ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BMQ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BMQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BMQ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BMQ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BMQ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BMQ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BMQ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BMQ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BMQ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BMQ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BMQ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BMQ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BMQ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BMQ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BMQ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms