Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB9F8W1W9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB9F8W1W9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB9F8W1W9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB9F8W1W9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPB9F8W1W9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms