Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PQ18 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PQ18 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PQ18 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PQ18 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PQ18 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PQ18 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E9PQ18 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PQ18 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PQ18 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PQ18 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PQ18 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PQ18 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PQ18 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PQ18 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PQ18 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PQ18 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PQ18 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PQ18 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PQ18 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PQ18 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PQ18 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PQ18 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PQ18 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PQ18 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PQ18 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PQ18 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PQ18 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PQ18 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PQ18 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PQ18 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PQ18 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PQ18 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PQ18 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PQ18 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PQ18 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PQ18 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PQ18 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PQ18 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PQ18 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PQ18 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PQ18 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PQ18 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PQ18 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PQ18 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PQ18 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PQ18 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PQ18 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PQ18 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PQ18 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PQ18 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PQ18 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PQ18 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PQ18 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PQ18 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PQ18 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PQ18 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PQ18 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PQ18 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PQ18 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PQ18 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PQ18 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PQ18 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PQ18 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PQ18 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PQ18 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PQ18 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PQ18 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PQ18 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PQ18 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PQ18 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PQ18 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PQ18 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PQ18 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PQ18 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PQ18 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PQ18 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PQ18 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PQ18 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PQ18 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E9PQ18 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E9PQ18 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E9PQ18 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E9PQ18 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E9PQ18 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E9PQ18 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E9PQ18 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E9PQ18 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E9PQ18 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E9PQ18 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E9PQ18 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms