Protein–RNA interactions for Protein: C9JCN9

HSBP1L1, Heat shock factor-binding protein 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSBP1L1C9JCN9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HSBP1L1C9JCN9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSBP1L1C9JCN9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSBP1L1C9JCN9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms