Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM25AB3EWG3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM25AB3EWG3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms