Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN2A8MW95 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BECN2A8MW95 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BECN2A8MW95 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BECN2A8MW95 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
BECN2A8MW95 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BECN2A8MW95 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BECN2A8MW95 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BECN2A8MW95 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BECN2A8MW95 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BECN2A8MW95 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BECN2A8MW95 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BECN2A8MW95 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BECN2A8MW95 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BECN2A8MW95 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BECN2A8MW95 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BECN2A8MW95 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BECN2A8MW95 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BECN2A8MW95 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BECN2A8MW95 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BECN2A8MW95 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
BECN2A8MW95 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BECN2A8MW95 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BECN2A8MW95 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BECN2A8MW95 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN2A8MW95 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN2A8MW95 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN2A8MW95 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BECN2A8MW95 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN2A8MW95 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN2A8MW95 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BECN2A8MW95 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BECN2A8MW95 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BECN2A8MW95 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
BECN2A8MW95 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
BECN2A8MW95 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BECN2A8MW95 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms