Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf47A7E2U8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf47A7E2U8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4orf47A7E2U8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms