Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L1PA6NM43 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms