Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM23A6NLE4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM23A6NLE4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM23A6NLE4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms