Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ARID3CA6NKF2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ARID3CA6NKF2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARID3CA6NKF2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ARID3CA6NKF2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms