Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF316A6NFI3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF316A6NFI3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZNF316A6NFI3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF316A6NFI3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms