Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S2A0A599 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRBV5S2A0A599 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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