Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 596.8 ms