Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC42Q9Y546 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC42Q9Y546 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC42Q9Y546 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms