Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FARP1Q9Y4F1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FARP1Q9Y4F1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FARP1Q9Y4F1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms