Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM50BQ9Y247 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM50BQ9Y247 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM50BQ9Y247 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM50BQ9Y247 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM50BQ9Y247 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM50BQ9Y247 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM50BQ9Y247 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM50BQ9Y247 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM50BQ9Y247 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM50BQ9Y247 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM50BQ9Y247 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM50BQ9Y247 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms