Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP4E1Q9UPM8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
AP4E1Q9UPM8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
AP4E1Q9UPM8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms