Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE7

STUB1, E3 ubiquitin-protein ligase CHIP, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1Q9UNE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STUB1Q9UNE7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
STUB1Q9UNE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STUB1Q9UNE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms