Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
MLH3Q9UHC1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
MLH3Q9UHC1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
MLH3Q9UHC1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MLH3Q9UHC1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms