Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-2Q9UD57 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-2Q9UD57 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms