Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4Q9UBX2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUX4Q9UBX2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms