Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL2Q9UBQ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXTL2Q9UBQ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms