Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOP53Q9NZM5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP53Q9NZM5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms