Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6AQ9NYA3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6AQ9NYA3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6AQ9NYA3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6AQ9NYA3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6AQ9NYA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6AQ9NYA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6AQ9NYA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6AQ9NYA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6AQ9NYA3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms