Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C2orf42Q9NWW7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf42Q9NWW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms