Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNB1IP1Q9NPC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms