Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BARX1Q9HBU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BARX1Q9HBU1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX1Q9HBU1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX1Q9HBU1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms