Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP29Q9HBJ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP29Q9HBJ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms