Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPCSQ9HAB8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCSQ9HAB8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPCSQ9HAB8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPCSQ9HAB8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms