Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP140LQ9H930 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140LQ9H930 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms