Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXF3Q9H4D5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NXF3Q9H4D5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NXF3Q9H4D5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NXF3Q9H4D5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms