Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL4Q9C0H6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL4Q9C0H6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL4Q9C0H6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms