Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM15Q9C019 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM15Q9C019 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM15Q9C019 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms