Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms