Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG6Q9BXT2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG6Q9BXT2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms