Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA9Q9BWV2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA9Q9BWV2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA9Q9BWV2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms