Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf16Q9BUW7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf16Q9BUW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf16Q9BUW7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms