Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RSRP1Q9BUV0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms