Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GINS4Q9BRT9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms