Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ALS2Q96Q42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ALS2Q96Q42 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ALS2Q96Q42 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ALS2Q96Q42 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms