Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2CR12Q96Q35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2CR12Q96Q35 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms