Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GBP4Q96PP9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GBP4Q96PP9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GBP4Q96PP9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GBP4Q96PP9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms