Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD27Q96NW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD27Q96NW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD27Q96NW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.4 ms