Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TOX2Q96NM4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOX2Q96NM4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms