Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNPC3Q96LT9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNPC3Q96LT9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RNPC3Q96LT9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms