Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF2Q96GP6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF2Q96GP6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF2Q96GP6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF2Q96GP6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF2Q96GP6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF2Q96GP6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF2Q96GP6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF2Q96GP6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF2Q96GP6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF2Q96GP6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF2Q96GP6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF2Q96GP6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms