Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTERF3Q96E29 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF3Q96E29 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTERF3Q96E29 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms