Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI2Q96DH6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MSI2Q96DH6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSI2Q96DH6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSI2Q96DH6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSI2Q96DH6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSI2Q96DH6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSI2Q96DH6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MSI2Q96DH6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSI2Q96DH6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSI2Q96DH6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms